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一間新印象公司旗下的業務員接連發生襲擊重傷案件，嫌犯甚至威脅社長支付現金，指定要求讓毛利小五郎來交付，並且用紙條要求他坐上隅田川出發的賞花船，還得把裝滿現金的公事包放在船頂上。警方和柯南在追蹤船的時候，赫然發現公事包竟然在眨眼之間消失！

第1集【外交官殺人事件】（上）服部平次有關西的工藤新一之稱，此次找到偵探社來一探傳聞的究竟，卻碰上一宗外交官被殺的案件，服部為了與新一一較高低，便以這個案件決勝負，新一會適時的出現嗎？....

第24集【再見，逆轉終審】，為了爭取救援真宵的時間，成步堂逼不得已、只好緊咬著霧緒犯案的可能性這點不放。在幾乎要判王都樓有罪的時候，突然出現了一名新證人，這個人竟然就是動手殺害藤見野勳的兇手‧虎狼死....

第12話【藍天】，啄木身體急速惡化，拜託京助跟蹤在教會看見的可疑男人。啄木確信一連串靠告發信揭發社會問題的事件背後，都有個他稱為告發者X的真凶。這個X究竟是誰？他真正的目的又是？另一方面，文人們今天也....

第1話【我回來了,希望峰學園】，這裡是集結了擁有超高校級才能的學生的政府公認特權學園「私立希望峰學園」。原為超高校級家政婦的新任教師雪染千紗來到了這裡任教。胸懷大志的雪染踏進了教室，卻發現教室裡頭卻只....

交錯的心願——隱藏在人群吵雜聲後的故事。20XX年。新宿區內接連發生由神秘組織「阿多尼斯」犯下的惡性連環犯罪事件。——通稱「X-Day事件」。警察「星野市香」在化為危險地區的新宿，為了維護地方治安日夜....

第24話【壞人所愛之物】，“要確切殺死盯上的獵物”回到了巴身邊的魯邦，遭遇瑪蒂亞的暗殺。她的眼中，映照出了詛咒自己人生的苦惱。魯邦勇敢迎戰，卻有一發子彈打斷了他們的對決。次元、不二子出現。“堂堂大盜，....

第24話【鄉壞篇七】，因艾烏亞施加的力量，雛見澤正在失去曾經的模樣。這影響，最終波及到了某個人物…。這是成為非人之物的少女，圍繞「業」展開的故事——。....

第136集【黑暗組織來的女子、大學教授殺人事件（四之一）】，柯南的班上來了一個轉學生，灰原哀的態度非常冷漠，卻似乎對柯南極感興趣，於是隨著步美一行人展開少年偵探隊的調查，為隔壁班的男生中田俊也找尋失蹤....

第510集【怪盜基德與四幅名畫，下集】，及川工作室裡發生的命案，包括消失了的新畫，一切看起來都像是基德所為，然而就在高木用一個小魔術表示了他對這個事件的想法時，柯南終於明白這一切是怎麼一回事，包括所謂....

第89集【綁架現場確定事件】，柯南與朋友們無意間從計程車無線電接收器聽到綁架事件，嫌犯表示，能看清被害人父親的一舉一動，若有任何異常舉動就會殺了他的女兒。柯南利用阿笠博發明的筆記型電子地圖，想找出嫌犯....

第421集【佇立在窗邊的女人上集】，這一天步美在路上跌倒，認識了一位好心幫她擦藥的大姊姊。隔天她帶著柯南等人一起去認識這位姊姊，竟意外發現她好像跟人結了怨，有人要害她，無奈走訪之後沒有收穫。柯南等人....

第1話【開始】，社團有一條規範寫著：不要一個人在入夜的校舍裡單獨行動！看似正常、歡樂的校園生活，卻不知道即將面臨的是一場令人窒息的嗜血追逃？！學園生活社的吉祥物小狗「太郎丸」趁大家不注意時，偷偷溜出學....