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第303集【不可思議的少年】，柯南詢問步美、元太和光彥今晚是否也要去觀測飛碟。這個月接到了三次在米戶橋附近的河灘目擊到飛碟的消息，身為少年偵探團的光彥等人怎能坐視不管。據目擊者表示當時是有一個金色的發光物體以極快的速度飛了過來……

第1話【MEMORY in CHILDREN 1/3】，有半數居民都是能力者的城鎮咲良田市。居住在那裡的少年淺井惠，擁有能完全保持自身記憶的能力。他在同學相麻菫的介紹下，與缺乏情感的少女春埼美空相遇。....

第421集【佇立在窗邊的女人上集】，這一天步美在路上跌倒，認識了一位好心幫她擦藥的大姊姊。隔天她帶著柯南等人一起去認識這位姊姊，竟意外發現她好像跟人結了怨，有人要害她，無奈走訪之後沒有收穫。柯南等人....

第1集【柯南對怪盜基德(上)】，怪盜基德名振天下、偷遍世界珍寶、目前將焦點放在日本、並寄出通知函預言要盜取鈴木集團傳家之寶：暗夜星辰、鈴木園子為目賭基德廬山真面目、不欲求助警方、遂央請好友小蘭的父親偵....

世界最頂尖的偵探培育學校BLUE，以前曾經出過一位才華卓越，前途光明的天才，但是他作為偵探有一個致命的缺陷，導致他被趕出BLUE，禁止繼續當偵探。五年後，一位警視廳搜查一課的刑警一色都都丸來找每天都過....

曾經盛極一時的日本忍者，因為戰後解散組織消失無蹤。事實上，忍者至今仍暗中存在，部分精銳忍者負責執行秘密任務，下級忍者卻是經常拿不到工作，過著宛如尼特族般的生活。....

第15話【神樂篇四】，經過漫長的戰鬥，梨花獲得了能真正殺死輪迴者的神劍．鬼狩柳櫻。在各種思緒交錯中，梨花做出了最後的決定。這是已經不再為人，與命運抗衡的少女們的，“畢業”的故事——。....

第12話【轉世的坦桑石】，正義的父親，染野閑突然出現在正義的眼前。雖然染野和裕美在正義小學時就離婚了，但他卻開始接近長大的的正義。然而當場雖將他趕跑了，但他開始出現在正義平常去的地方。不想給理察和周遭....

在育幼院度過童年的雙胞胎少年米奇與達利，某天被一對過著富裕又安穩生活的老夫婦——園山夫妻收為養子。但是被收養的不是「米奇」和「達利」兩個人，而是以一個少年「園山秘鳥」的身份被收養了下來。他們隱瞞著自己....

第1集【嚇一跳！？太郎變身了？】，《月刊妄想科學》是一本處理科學無法解釋的神祕現象的月刊。在編輯部工作的三個人分別是夢想從壽退休並想成為全職家庭主婦的太郎、略帶厚臉皮的高智商男孩次郎和小狗三郎。....

西元1999年，近未來的東京頻頻發生作業機械人＜LABOR＞的犯罪問題。一名突然跳海自殺的天才程式設計師，由他所引發的一連串驚人狀況究竟是……....

第45集【崛田三兄弟殺人事件】，崛田文子的男友健太郎本是一鋼琴家，向崛田先生提婚不成，卻遭其傷害手指，無法彈琴因而輕生，5年後健太郎之父為其報仇，將崛田先生炸死，在柯南的推理下才道出過去這段往事。　....

第1話【妖鬼殺手】，明治30年，在怪異現象頻發的東京，真打津輕在一個能讓觀眾觀看怪物們自相殘殺的小屋中工作，他被稱作「妖鬼殺手」。這天，一位只有頭顱的美少女——輪堂鴉夜，帶著她的女僕——馳井靜句來到他....