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第344集【消失在懸崖的柯南(後篇)】，柯南、灰原、步美、元太、光彥去阿笠博士朋友的別墅玩。結果在那裡發現受了傷的駭客‧伊勢原。伊勢原本是被稱為蘇洛的搶匪‧溝呂木的同夥，但現在卻被視為叛徒追殺。柯南協助伊勢原逃離溝呂木和其同伴，豈料最後被逼到斷崖……

第556集【紅白黃色和偵探團】，茱蒂老師打電話通知柯南，表示黑暗組織的新員開始行動了，代號是波本目標可能是灰原哀，另外杉浦開人同學說，他們家公寓裡的某個房客每晚都有可疑的舉動，想拜託少年偵探團去調查不....

第401集【解開紅葉公館之謎 (上集)】，柯南在無意間救了一個差點被車撞上的女孩，原來這個女孩是不動產王片寄王三郎領養的孫女，柯南他們在王三郎邀請下來到紅葉公館並且留下來作客，不料王三郎竟然在下午的約....

在殺意和猜忌環伺的學園，究竟誰能從中畢業？據說能進入學園的人，肯定是菁英中的菁英。據說光是從那裡畢業的學員，人生等於成功了一半。苗木誠是透過抽獎獲得入學的幸運兒，校長在歡迎入學的新生們是這麼致詞的：從....

第1話【其神之名】，琴子接到一處公寓地縛靈的委託，它聲稱附近有「謎樣的怪異」。該棟公寓的空屋每到深夜就會傳出奇怪聲響，並且地上出現有著四隻手臂、長得像怪物的人偶。為了查出這神祕怪異的真面目，琴子與九郎....

第1話【羊布偶裝】，小鳩常悟朗和小佐內由紀約好要當安穩低調的小市民，順利考上同一所高中。4月的某天，小佐內要小鳩陪她去買草莓塔，小鳩卻被叫去尋找校內失竊的包包。突然遭遇事件的兩人，有辦法安穩地放學嗎？....

第11話【閃光的未必都是金子】，跟著茂丸逃出貨船的大助和加藤，抵達了神戶集團曾經的第三研究所遺址。那裡是所有謎團開始的地方。大助向家主．喜久子追問當初的事情，然而在得知真相之後，大助的面前出現了新的選....

第1話【扭來扭去的狩獵】，紙越空魚發現了真實怪談中提及的怪異徘徊的世界“裏世界”的存在，時常前往探索。有一天，空魚遭遇了怪異，身體無法動彈，這時出現了一位美少女。她名叫仁科鳥子。她出於某種目的，前來探....

第418集【目標毛利小五郎】，有個三年前曾經被小五郎逮捕的小偷、出獄之後不但整型還改了戶籍就是為了對小五郎進行報復、讓一切看起來好像是別人把小五郎誤認成一個叫木村的人、所進行的復仇計畫…....

第1集【外交官殺人事件】（上）服部平次有關西的工藤新一之稱，此次找到偵探社來一探傳聞的究竟，卻碰上一宗外交官被殺的案件，服部為了與新一一較高低，便以這個案件決勝負，新一會適時的出現嗎？....

因受邀參加新辦公大樓落成紀念電影《大怪獸哥梅拉VS假面超人》的製作發表會，柯南等人來到大阪的日賣電視台。製作發表期間，幹練的製作人米倉在倉庫發生意外，遭巨大的怪獸模型壓倒死亡。支撐模型的繩索被人用刀子....

第1集【嚇一跳！？太郎變身了？】，《月刊妄想科學》是一本處理科學無法解釋的神祕現象的月刊。在編輯部工作的三個人分別是夢想從壽退休並想成為全職家庭主婦的太郎、略帶厚臉皮的高智商男孩次郎和小狗三郎。....

風不斷地吹拂著這座城市。無論是小小的幸福，還是重大的不幸，都是乘風而來。風的城市──風都。過去威脅這座城市的組織「博物館」，已由假面騎士們逼入絕境。可是，該組織所大量生產的危險道具「蓋亞記憶體」仍四散....