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第170集【詭異的五重塔傳說（下集）】，原來殺害小田社長的人是小田飯店的經理浘村，他為公司逃漏稅，最後小田社長又要他一個人扛下所有的責任，氣憤不過，才會利用五重塔的傳說，與因為主題公園開發案拿到的平面圖得知寺內塔高，古井位置等條件設計了這一起看似自殺的謀殺計劃。

第1集【浪花連續殺人事件】（上）柯南與小蘭毛利一行人受服部平次之邀，來到大阪參觀，一路吃了許多大阪的名產，就在中途遇到一名死者從大樓上摔下，且已死亡一日，這件案子與之前大阪發生的前兩宗殺人案息息相關，....

第1話【MEMORY in CHILDREN 1/3】，有半數居民都是能力者的城鎮咲良田市。居住在那裡的少年淺井惠，擁有能完全保持自身記憶的能力。他在同學相麻菫的介紹下，與缺乏情感的少女春埼美空相遇。....

第1話【開球儀式】，殺人承包公司的新進社員・齋藤被降級調職到殺手激戰區的博多。同一時刻，被委託調查刑警自殺事件的偵探．馬場，收下了一張死去的刑警留下的照片。照片上竟有那位負面傳言不斷的現任市長的身影。....

第12話【藍天】，啄木身體急速惡化，拜託京助跟蹤在教會看見的可疑男人。啄木確信一連串靠告發信揭發社會問題的事件背後，都有個他稱為告發者X的真凶。這個X究竟是誰？他真正的目的又是？另一方面，文人們今天也....

第1集【復活的怪盜基德】，中森青子在教室和朋友談論世界知名、會變魔術的大盜怪盜基德在美術館現身一事。就在這時，黑羽快斗前來和青子爭論了起來。看到快斗在課堂上展現魔術，青子便挑釁地說即使是快斗也贏不過基....

第459集【名偵探柯南加長版特別節目-黑色衝擊！組織之手逼近的瞬間】，女主播水無憐奈拜託小五郎調查一件奇怪的事情，她家的門鈴連續兩個月無故響起，但卻從未發現有任何人出現在附近的跡象，並且門口還曾出現過....

第45集【崛田三兄弟殺人事件】，崛田文子的男友健太郎本是一鋼琴家，向崛田先生提婚不成，卻遭其傷害手指，無法彈琴因而輕生，5年後健太郎之父為其報仇，將崛田先生炸死，在柯南的推理下才道出過去這段往事。　....

在繁華都市的某個角落，有一家叫做“時光照相館”的小店還在照常營業。雖然門庭冷落，但它背後其實由兩個具有特殊能力的男人——程小時和陸光經營著。為了完成顧客的委託，陸光和程小時組隊配合使用超能力進入照片，....

第12話【轉世的坦桑石】，正義的父親，染野閑突然出現在正義的眼前。雖然染野和裕美在正義小學時就離婚了，但他卻開始接近長大的的正義。然而當場雖將他趕跑了，但他開始出現在正義平常去的地方。不想給理察和周遭....

第1話【妖鬼殺手】，明治30年，在怪異現象頻發的東京，真打津輕在一個能讓觀眾觀看怪物們自相殘殺的小屋中工作，他被稱作「妖鬼殺手」。這天，一位只有頭顱的美少女——輪堂鴉夜，帶著她的女僕——馳井靜句來到他....