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第568集【明治維新神祕之旅(解讀篇)】，柯南他們在津和野發現了新的暗號，和古代荻市的地圖還有日記裡面的貓圖，於是他們順著線索來到了荻市，柯南目擊到阿茂先生和襲擊公子小姐的男子會面，接著又有一群神秘男子出現擄走了公子和灰原以及光彥，沒想到原本的尋寶任務變成了綁架事件…

鏡頭拉回到多年以前，揭開了九條家和「那個人」之間的秘密，玲對眼前娓娓訴說的他擔心不已，但是「他」卻話鋒一轉，說要取她性命！？無名事件相關人士之間的謎團終於揭開，而陷害九條的幕後黑手又是誰呢？....

第1集【外交官殺人事件】（上）服部平次有關西的工藤新一之稱，此次找到偵探社來一探傳聞的究竟，卻碰上一宗外交官被殺的案件，服部為了與新一一較高低，便以這個案件決勝負，新一會適時的出現嗎？....

第418集【目標毛利小五郎】，有個三年前曾經被小五郎逮捕的小偷、出獄之後不但整型還改了戶籍就是為了對小五郎進行報復、讓一切看起來好像是別人把小五郎誤認成一個叫木村的人、所進行的復仇計畫…....

風不斷地吹拂著這座城市。無論是小小的幸福，還是重大的不幸，都是乘風而來。風的城市──風都。過去威脅這座城市的組織「博物館」，已由假面騎士們逼入絕境。可是，該組織所大量生產的危險道具「蓋亞記憶體」仍四散....

「夜斗」是個經營神明到府服務，為了五圓香油錢承接人們委託的大小事，居無定所的流浪神。最近由於夥伴伴音扔下一句「本能無法接受」而辭退，他終於連神器也失去了。這一天，他忙著尋找走失的家貓，途中眼看就要被車....

病例1【流冰,奇美拉病的男人】，克羅斯瓦德是一位資產家，住在一座孤島上的城堡裡，他罹患了一種會重複攝取並排出大量水分的怪病。想要解開這個怪病之謎的黑傑克，最後發現這座島上，並不是只有克羅斯瓦德受到這種....

第1話【羊布偶裝】，小鳩常悟朗和小佐內由紀約好要當安穩低調的小市民，順利考上同一所高中。4月的某天，小佐內要小鳩陪她去買草莓塔，小鳩卻被叫去尋找校內失竊的包包。突然遭遇事件的兩人，有辦法安穩地放學嗎？....

以赤井秀一為中心，聚焦於世良純真、羽田秀吉、瑪麗各自的個性與看點，並解明其關聯。無可比擬的攻防戰過後，赤井的回歸為所有觀眾帶來了衝擊。而一連串”不在場證明”真相的背後，都有柯南的身影——。....

第24話【壞人所愛之物】，“要確切殺死盯上的獵物”回到了巴身邊的魯邦，遭遇瑪蒂亞的暗殺。她的眼中，映照出了詛咒自己人生的苦惱。魯邦勇敢迎戰，卻有一發子彈打斷了他們的對決。次元、不二子出現。“堂堂大盜，....

第1集【浪花連續殺人事件】（上）柯南與小蘭毛利一行人受服部平次之邀，來到大阪參觀，一路吃了許多大阪的名產，就在中途遇到一名死者從大樓上摔下，且已死亡一日，這件案子與之前大阪發生的前兩宗殺人案息息相關，....