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第1035集【河對岸的事件】，少年偵探團五人相約一起賞鳥，但是興致缺缺的柯南，卻以偵探訓練為藉口，鼓吹大家觀察河對岸的路人。正當大家開始體會箇中樂趣的時候，幾個熟悉的身影卻映入了望遠鏡——高木警官帶領著警方正在埋伏犯人。

第12話【怪病醫拉姆尼】，這天是克洛身為病患接受診察的日子。拉姆尼以醫生的身份，判斷克洛的怪病已經痊癒。原本克洛在治療的同時也兼當徒弟，他詢問拉姆尼是不是別再來診所比較好。拉姆尼內心其實希望他來，但回....

在育幼院度過童年的雙胞胎少年米奇與達利，某天被一對過著富裕又安穩生活的老夫婦——園山夫妻收為養子。但是被收養的不是「米奇」和「達利」兩個人，而是以一個少年「園山秘鳥」的身份被收養了下來。他們隱瞞著自己....

第1話【我回來了,希望峰學園】，這裡是集結了擁有超高校級才能的學生的政府公認特權學園「私立希望峰學園」。原為超高校級家政婦的新任教師雪染千紗來到了這裡任教。胸懷大志的雪染踏進了教室，卻發現教室裡頭卻只....

第1話【寶月夜宵】，擁有靈異體質的螢多朗，自從將朋友捲入靈障的風波之後，就過著足不出戶的生活。受到青梅竹馬詠子的鼓勵，他開始打工當家教，但負責的學生卻是有著超強力靈異體質的天才少女夜宵。夜宵一眼就看出....

第556集【紅白黃色和偵探團】，茱蒂老師打電話通知柯南，表示黑暗組織的新員開始行動了，代號是波本目標可能是灰原哀，另外杉浦開人同學說，他們家公寓裡的某個房客每晚都有可疑的舉動，想拜託少年偵探團去調查不....

以赤井秀一為中心，聚焦於世良純真、羽田秀吉、瑪麗各自的個性與看點，並解明其關聯。無可比擬的攻防戰過後，赤井的回歸為所有觀眾帶來了衝擊。而一連串”不在場證明”真相的背後，都有柯南的身影——。....

第12話【藍天】，啄木身體急速惡化，拜託京助跟蹤在教會看見的可疑男人。啄木確信一連串靠告發信揭發社會問題的事件背後，都有個他稱為告發者X的真凶。這個X究竟是誰？他真正的目的又是？另一方面，文人們今天也....

第24話【最後一案第二幕】，打算以自身的死亡完成計畫的威廉。在他那股堅強的意志下，阿爾伯特等人為了完成自身的職責而開始行動。另一方面，受「犯罪卿」威廉所託負責劃下句點的「偵探」夏洛克，也看穿了威廉執....

第1話【深具傳統的古籍社之重生】，一向奉行節能主義，能不做的事就不做的折木奉太郎，因為姊姊的命令，只好加入了面臨廢社的古籍社。在那裡，他遇見了對凡事都充滿好奇的大小姐千反田愛瑠，奉太郎期望中風平浪靜的....

第13話【為了影家人】，凱特終於來到艾蜜莉可的身邊，但這一切都在愛德華的計畫之中。倘若兩人就這麼被愛德華囚禁到天亮，便無可避免會被當成叛亂份子遭到懲處。而在這可說是絕望的狀況之中，出現了兩個形跡可疑的....

第319集【窮途末路黑暗中的柯南(前篇)】，黑暗中，柯南忽然睜開眼睛，發現自己處於被封住嘴巴、被繩子綁住，無法發出聲音又動彈不得的狀態。他冷靜下來，試圖回想自己為何會落得如此田地。柯南發覺自己身在一個....

第45集【崛田三兄弟殺人事件】，崛田文子的男友健太郎本是一鋼琴家，向崛田先生提婚不成，卻遭其傷害手指，無法彈琴因而輕生，5年後健太郎之父為其報仇，將崛田先生炸死，在柯南的推理下才道出過去這段往事。　....